| 办公室
办公室是民族博物馆的综合管理、服务的职能部门，主要体现管理与协调作用。主要职责是：保证馆内各项决议、指示及时地贯彻执行；加强对各部门之间的协调；抓好文秘、行政、财务、外事、房改、交通安全、固定资产、计划生育、绿化、献血、公费医疗等管理；随时掌握全馆工作进展情况，督促工作落实，为馆领导决策提供真实可靠信息，当好参谋与助手；协助馆领导做好思想政治工作等。
人事处
负责干部的考察、承办干部的任聘；人事调配、档案、工资、福利的管理；核定岗位津贴；职工的培训；临时工的聘用与管理；人事劳动工资的统计；老干部工作；纪检监察、群众团体（工、青、妇）工作。
研究部
负责制定短期和长期的研究计划；负责制定民族文物调查征集计划及组织实施；编辑学术论文及有关资料；负责图书、图片、音像制品的整理、分类、登记、编目、借阅等。
展演部
承担本馆各类展览的内容设计、形式设计和美术制作；承接社会各类展览的内容设计、形式设计和美术制作；围绕各类展览进行民族学、民俗学、民族史、民族博物馆学等方面的专题研究；负责民族文物的对外展览工作。
开展对我国56个民族传统服饰文化理论的研究；设计和推广新的民族服饰；组织策划并实施与服饰相关的展演活动。
保管部
负责文物的整理、分类、登记、编目、日常保管以及开展馆藏文物的研究，编撰馆藏文物图录等。
事业发展中心
负责对外交流与合作；围绕事业发展，策划短期项目及长期项目并组织实施。
福佑寺管理办公室
负责福佑寺的安全保卫、消防、环境卫生、绿化美化等工作。
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